Den dag i dag kendes de sygdomsfremkaldende mekanismer ved multipel sklerose ikke fuldt ud. Derimod er der visse teorier om, hvad der udløser sygdommen
Forskerne har længe haft en mistanke om, at vira kan være den udløsende faktor, også selv om man ikke helt præcis ved, hvilke vira det drejer sig om. De fleste forskere mener, at flere almindelige vira kan aktivere immunforsvaret, og på den måde få multipel sklerose til at bryde ud. Også miljøfaktorer er blevet fremhævet som en mulig forklaring på multipel sklerose. Hvis vi ser på verden som helhed, er der nemlig store geografiske forskelle i udbredelsen af multipel sklerose, og Skandinavien er én af de regioner, hvor multipel sklerose er mest almindelig. Det har betydet, at klimaet og vores kost er kommet i søgelyset, men det er ikke lykkes at finde et endegyldigt bevis.
Det ser altså ud til, at man kan få multipel sklerose via tilfældige hændelser, som for eksempel en virusinfektion i kombination med en vis genetisk disposition, der gør, at immunforsvaret begynder at angribe kroppens egne nervetråde.
Kombinationen af forskellige faktorer er i dag den stærkeste teori. At der skal ske et uheldigt sammenspil mellem flere forskellige faktorer betyder, at man kalder multipel sklerose for en multifaktoriel sygdom.